EZアプリ版の相違
以下はEZアプリ版バージョン1.1.0時点で確認された、PS版とEZアプリ版の相違点の一覧。細かく見ていけばまだ多数存在するでしょう。遺跡ダンジョン制覇や闘技場制覇は未プレイ。i-mode版やS!アプリ版とは仕様が異なる可能性あり。
全体的な演出の簡略化・劣化
- ムービーの削除（基本的にフォローはされない）
- グラフィックの簡略化（当然といえば当然、背景は結構綺麗）
- BGMが着メロっぽい音に劣化し、さらに短縮バージョンになった
- 多くのBGMの使用場面の変更、無音の箇所さえも（これは残念、全然合わないシーンも多数）
- アークを除く各キャラのテーマなど、かなりの数の曲が削除
- ほとんどの効果音の削除
- 特殊能力を除くほとんどのボイス削除（バーングラウンド！とかはあります）
- 通常攻撃や特殊能力で効果音が鳴っている間はBGMが鳴らない
- 顔グラフィック削除（会話時は名前表示のみ、ステータス画面では操作キャラの絵が表示）
- 一部の演出の簡略化（拡大縮小など）
- 背景の自動スクロールの削除
- 移動やスクロールはかなりもっさり（機種によって異なる可能性も）
- エンディングムービーだけは通常画面でそれなりに再現
- エンディングのスタッフロールの完全削除
演出の強化・変更
- 特殊能力のグラフィック変更（バーングラウンドは火柱など、LVに応じて変動もする）
- 通常攻撃のパターン変更（連続攻撃がちょっと派手に）
- 通常攻撃時に時々カットイン演出が入る（条件不明、イベントでのカットインは確認できず）
- ステータス異常がアイコン等で表示
- 戦闘時に操作しないと出るHP・MP表示とフリーカーソル時のHP・MP表示が統一され、画面上部のシンプルなウィンドウに変更
- 決定ボタンで一部メッセージの高速化が可能
細かい演出のカット
- アークの家に帰った時の外画面の削除
- ポコが部隊を追いかけて転んだ際に、ボイスのかわりにメッセージで「いてえ」
- 空港のグラフィックが各国共通
- 飛行船の飛び立ち映像カット
- 飛行船のプロペラが無い
- 軍本部と闘技場で、仲間やNPCが歩き回らない
- 軍本部の女の子に話し掛けてもじいさんと入れ替わらない
- クリア後のオルニスの丘にはアーク一人しかおらず、ボイスイベントは全てカット（すごいアイテム関連も）
- チョンガラ加入時の「ぎょえ～」ボイスが削除、ただ往復してるように見える
- グレイシーヌ初到着時のラマダ僧の説明の際に画面がスクロールしない
- 大僧正の部屋にいるラマダ僧正のグラフィックが3人共通、喋っている者だけが明るくなる演出もカット
- ラマダ寺の扉が常に開いている
- ラマダ寺の修行の際には開いた扉の中にモンスターが5体突然出現する
- ヘモジー入手時のチョンガラが調べる演出が削除
- 戦闘不能時のスポットライト演出が削除
- 戦闘時のステータス等のウィンドウが柄の無い半透明のものに変更
- サリュ族の村に初めて入った際に、最初から村を見下ろせる（スクロールなし）
- オドン加入時にパーティメンバーが瀕死ポーズを取らない
- パレンシア城の地下エレベータの動きが削除
- ダークアークたちは通常キャラの半透明バージョンに変更
- 特殊能力のアニメーション中に効果範囲が表示されない（敵の特殊能力は効果が出るまで誰が狙われたか分からない）
- 「ヒートウォール」を巻き込んでもウインドスラッシャーが変色しない（属性変動は不明）
- レベルアップ時にキャラに演出が入らない（複数キャラを対象とした行動でレベルアップすると、上昇パラメータ等で判断するか、後から確認するしかない）
ゲームバランス関連
- レベルアップ時のパラメータ上昇量が全体的にアップ
- モンスターの思考ルーチンが変更され、頭が悪くなった（メデューサリザード等強化されたものも）
- スケルトンのHP1状態が削除
- エレメンタル系モンスターが合体しない？
- グラ・アピスが特殊能力を使わない？
- ネビュラス等一部のモンスターのMPが上昇
メッセージ関連
- アークの家の手紙を読むかどうか、1回目から確認メッセージが出るようになった
- 闘技場の参加者締め切りアナウンスの頻度が低下
- フリーバトルエリア突入時のメッセージがアークの「戦闘になるぞ。いいか？」のみ
- 「ぶんれつ」「たねとばし」の特殊能力名表示がされない
- ラリュウキの魔法名が表示される
- バット系モンスターの特殊能力「超音波」の名前が表示される
- ラマダ大僧正の特殊能力「火柱」「パワーゲイザー」の名前が表示される
名称変更
- 一部の特殊能力の名前が漢字化（「しゅうい攻撃」→「周囲攻撃」など）
- 「鬼神流影波」の名前が「鬼神竜影波」に変更
- 「ヒートウォール」で出現する炎の名前が「炎」から「ヒートウォール」に変更
- ウィザード専用だった特殊能力「ダイアモンドダスト」が「ダイヤモンドダスト」に変更
仕様変更と思われるもの
- リングメニューの廃止、アイコンが横に並ぶメニューに
- パラメータアップの装備をしても玉の表示が出ない代わりに、数値が直接変動
- 反撃後に相手の方向を向いたままになる
- 一部のマップが狭くなり、それにともなって形状が変化
- ラマダ寺のクイズの答えが演出の変更に伴って変更（21人→13人）
- チョンガラの「調べる」削除
- モンスターずかん削除
- 「調べる」削除に伴って、トウヴィルでのチョンガラの会話内容からも図鑑関連の話が消え、「としじゃよ」というメッセージに変更
- 特殊能力の射程や効果範囲が壁によって遮られない
ミスと思われるもの
- 軍本部にスパイがいない
- トッシュ脱獄直後の謁見の間で、画面外に消えたはずのアークの手？がわずかに見える
- 遺跡ダンジョンのアイテム配置が異なる（B4のスリープレスカードの代わりに技のブレスレットが…B3も技のブレスレット）
- アゼンダ高地で、ゆか造りで作った床から本来の床へジャンプできない
- 初期レベルのイーガが「退魔光弾」を習得していない代わりに「旋風撃蹴」を習得している（「退魔光弾」はLV22で修得）
- 闘技場でこうたいしてもカーソルが操作キャラに合わない（どころかなぜか関係のない2ページ目を指すことも）
- レベルアップ時のパラメータ上昇量表示が内部値になった（恐らく従来の0.2ポイント＝1ポイント）、ただしパラメータ画面では従来通り5で割ってから小数点部分を切り捨てた表示となっている
- アーク専用装備「古代の指輪」が誰でも装備できる
その他
- 新しいエリアに入ったときなどに追加データを頻繁にダウンロード（多いときで最大60KBの通信を11連発、定額制必須）
- 遺跡ダンジョンで階段を下りる度に通信（B5までの範囲では、昇りは無しっぽい）
- セーブデータは1つ限定
- スタート時はエリアマップ風の画面に「はじめから」「つづきから」等のメニュー
- バトルエリア突入前のセーブ確認削除
- 戦闘開始前の装備変更画面の削除
- 戦闘終了後のリザルト画面の削除
- 操作時のヘルプメッセージの削除（特殊能力の説明は見られる）
- エンディングでのセーブ画面の削除（内部的にはセーブされている？）